Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PODXL2Q9NZ53 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PODXL2Q9NZ53 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PODXL2Q9NZ53 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PODXL2Q9NZ53 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PODXL2Q9NZ53 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PODXL2Q9NZ53 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PODXL2Q9NZ53 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PODXL2Q9NZ53 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PODXL2Q9NZ53 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PODXL2Q9NZ53 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PODXL2Q9NZ53 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PODXL2Q9NZ53 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PODXL2Q9NZ53 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PODXL2Q9NZ53 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PODXL2Q9NZ53 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PODXL2Q9NZ53 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PODXL2Q9NZ53 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PODXL2Q9NZ53 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PODXL2Q9NZ53 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PODXL2Q9NZ53 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PODXL2Q9NZ53 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PODXL2Q9NZ53 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PODXL2Q9NZ53 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PODXL2Q9NZ53 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PODXL2Q9NZ53 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PODXL2Q9NZ53 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PODXL2Q9NZ53 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PODXL2Q9NZ53 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PODXL2Q9NZ53 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PODXL2Q9NZ53 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PODXL2Q9NZ53 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PODXL2Q9NZ53 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PODXL2Q9NZ53 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms