Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MS4A12Q9NXJ0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms