Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR3EQ9NVU0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms