Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ASF1BQ9NVP2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ASF1BQ9NVP2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms