Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUD5

ZCCHC3, Zinc finger CCHC domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC3Q9NUD5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZCCHC3Q9NUD5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZCCHC3Q9NUD5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms