Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SERINC1Q9NRX5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SERINC1Q9NRX5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SERINC1Q9NRX5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SERINC1Q9NRX5 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SERINC1Q9NRX5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SERINC1Q9NRX5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SERINC1Q9NRX5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SERINC1Q9NRX5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SERINC1Q9NRX5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SERINC1Q9NRX5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SERINC1Q9NRX5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SERINC1Q9NRX5 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SERINC1Q9NRX5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SERINC1Q9NRX5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SERINC1Q9NRX5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SERINC1Q9NRX5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERINC1Q9NRX5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERINC1Q9NRX5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERINC1Q9NRX5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERINC1Q9NRX5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERINC1Q9NRX5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERINC1Q9NRX5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERINC1Q9NRX5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERINC1Q9NRX5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERINC1Q9NRX5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SERINC1Q9NRX5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms