Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
VPS45Q9NRW7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
VPS45Q9NRW7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VPS45Q9NRW7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
VPS45Q9NRW7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
VPS45Q9NRW7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS45Q9NRW7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS45Q9NRW7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS45Q9NRW7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS45Q9NRW7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS45Q9NRW7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS45Q9NRW7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS45Q9NRW7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS45Q9NRW7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS45Q9NRW7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS45Q9NRW7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS45Q9NRW7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS45Q9NRW7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS45Q9NRW7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS45Q9NRW7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS45Q9NRW7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS45Q9NRW7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS45Q9NRW7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms