Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPCPD1Q9NPB8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms