Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB9BQ9NP90 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB9BQ9NP90 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms