Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
PDE7BQ9NP56 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms