Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ3

DNAJC4, DnaJ homolog subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC4Q9NNZ3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DNAJC4Q9NNZ3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DNAJC4Q9NNZ3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DNAJC4Q9NNZ3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DNAJC4Q9NNZ3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DNAJC4Q9NNZ3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DNAJC4Q9NNZ3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJC4Q9NNZ3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJC4Q9NNZ3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJC4Q9NNZ3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJC4Q9NNZ3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJC4Q9NNZ3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJC4Q9NNZ3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJC4Q9NNZ3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJC4Q9NNZ3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJC4Q9NNZ3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJC4Q9NNZ3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJC4Q9NNZ3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJC4Q9NNZ3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJC4Q9NNZ3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJC4Q9NNZ3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJC4Q9NNZ3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJC4Q9NNZ3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAJC4Q9NNZ3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms