Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms