Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CENPJQ9HC77 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms