Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEBOXQ9HB31 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SEBOXQ9HB31 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEBOXQ9HB31 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEBOXQ9HB31 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEBOXQ9HB31 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEBOXQ9HB31 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SEBOXQ9HB31 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEBOXQ9HB31 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEBOXQ9HB31 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEBOXQ9HB31 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEBOXQ9HB31 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEBOXQ9HB31 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEBOXQ9HB31 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SEBOXQ9HB31 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms