Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PRKRIP1Q9H875 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKRIP1Q9H875 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms