Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NRDE2Q9H7Z3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRDE2Q9H7Z3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms