Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRDM12Q9H4Q4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms