Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLSTN2Q9H4D0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLSTN2Q9H4D0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms