Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PUS3Q9BZE2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PUS3Q9BZE2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms