Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GABARAPL3Q9BY60 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms