Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRIP1Q9BX63 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms