Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FNDC11Q9BVV2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms