Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NDFIP1Q9BT67 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NDFIP1Q9BT67 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NDFIP1Q9BT67 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDFIP1Q9BT67 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDFIP1Q9BT67 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDFIP1Q9BT67 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NDFIP1Q9BT67 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NDFIP1Q9BT67 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NDFIP1Q9BT67 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NDFIP1Q9BT67 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NDFIP1Q9BT67 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDFIP1Q9BT67 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NDFIP1Q9BT67 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NDFIP1Q9BT67 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDFIP1Q9BT67 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NDFIP1Q9BT67 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NDFIP1Q9BT67 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDFIP1Q9BT67 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NDFIP1Q9BT67 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDFIP1Q9BT67 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NDFIP1Q9BT67 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NDFIP1Q9BT67 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms