Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RTKNQ9BST9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms