Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOPXQ9BPY8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOPXQ9BPY8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOPXQ9BPY8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOPXQ9BPY8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOPXQ9BPY8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOPXQ9BPY8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOPXQ9BPY8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HOPXQ9BPY8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HOPXQ9BPY8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOPXQ9BPY8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms