Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPN18Q99952 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN18Q99952 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms