Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POP1Q99575 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POP1Q99575 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POP1Q99575 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POP1Q99575 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POP1Q99575 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POP1Q99575 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POP1Q99575 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POP1Q99575 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POP1Q99575 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POP1Q99575 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
POP1Q99575 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
POP1Q99575 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POP1Q99575 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POP1Q99575 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POP1Q99575 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POP1Q99575 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POP1Q99575 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POP1Q99575 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POP1Q99575 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POP1Q99575 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POP1Q99575 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POP1Q99575 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POP1Q99575 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
POP1Q99575 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
POP1Q99575 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
POP1Q99575 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
POP1Q99575 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POP1Q99575 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POP1Q99575 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POP1Q99575 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POP1Q99575 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
POP1Q99575 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POP1Q99575 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POP1Q99575 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POP1Q99575 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
POP1Q99575 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
POP1Q99575 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POP1Q99575 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POP1Q99575 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POP1Q99575 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POP1Q99575 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
POP1Q99575 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POP1Q99575 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POP1Q99575 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POP1Q99575 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POP1Q99575 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POP1Q99575 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POP1Q99575 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POP1Q99575 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POP1Q99575 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POP1Q99575 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POP1Q99575 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POP1Q99575 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POP1Q99575 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POP1Q99575 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POP1Q99575 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POP1Q99575 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POP1Q99575 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
POP1Q99575 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POP1Q99575 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POP1Q99575 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POP1Q99575 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POP1Q99575 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POP1Q99575 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POP1Q99575 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POP1Q99575 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POP1Q99575 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POP1Q99575 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
POP1Q99575 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POP1Q99575 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POP1Q99575 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POP1Q99575 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POP1Q99575 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POP1Q99575 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POP1Q99575 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
POP1Q99575 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POP1Q99575 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POP1Q99575 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POP1Q99575 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POP1Q99575 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POP1Q99575 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POP1Q99575 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POP1Q99575 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POP1Q99575 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POP1Q99575 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POP1Q99575 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POP1Q99575 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POP1Q99575 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POP1Q99575 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POP1Q99575 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POP1Q99575 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POP1Q99575 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POP1Q99575 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POP1Q99575 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POP1Q99575 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POP1Q99575 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POP1Q99575 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POP1Q99575 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POP1Q99575 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms