Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP88Q99567 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms