Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 AL079304.1-201ENST00000554595 828 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 SMIM11A-201ENST00000399292 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PHF12Q96QT6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms