Protein–RNA interactions for Protein: Q96QH2

PRAM1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAM1Q96QH2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRAM1Q96QH2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAM1Q96QH2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms