Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC38A2Q96QD8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A2Q96QD8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms