Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNGAP1Q96PV0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNGAP1Q96PV0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms