Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRP3Q96P20 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP3Q96P20 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms