Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
NSMCE2Q96MF7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NSMCE2Q96MF7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms