Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E2Q96LR5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms