Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EP400Q96L91 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EP400Q96L91 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms