Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDK5RAP3Q96JB5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5RAP3Q96JB5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms