Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COG3Q96JB2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COG3Q96JB2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms