Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RTP4Q96DX8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RTP4Q96DX8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RTP4Q96DX8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RTP4Q96DX8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
RTP4Q96DX8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RTP4Q96DX8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTP4Q96DX8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTP4Q96DX8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTP4Q96DX8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTP4Q96DX8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTP4Q96DX8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTP4Q96DX8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms