Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATG4CQ96DT6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG4CQ96DT6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms