Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RNF34Q969K3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RNF34Q969K3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RNF34Q969K3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RNF34Q969K3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RNF34Q969K3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RNF34Q969K3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms