Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CAVIN3Q969G5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAVIN3Q969G5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms