Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU6

GPBAR1, G-protein coupled bile acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBAR1Q8TDU6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GPBAR1Q8TDU6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GPBAR1Q8TDU6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPBAR1Q8TDU6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPBAR1Q8TDU6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPBAR1Q8TDU6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPBAR1Q8TDU6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPBAR1Q8TDU6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPBAR1Q8TDU6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPBAR1Q8TDU6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPBAR1Q8TDU6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPBAR1Q8TDU6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPBAR1Q8TDU6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPBAR1Q8TDU6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPBAR1Q8TDU6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPBAR1Q8TDU6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPBAR1Q8TDU6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPBAR1Q8TDU6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPBAR1Q8TDU6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPBAR1Q8TDU6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPBAR1Q8TDU6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPBAR1Q8TDU6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPBAR1Q8TDU6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPBAR1Q8TDU6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPBAR1Q8TDU6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPBAR1Q8TDU6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPBAR1Q8TDU6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPBAR1Q8TDU6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPBAR1Q8TDU6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GPBAR1Q8TDU6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPBAR1Q8TDU6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPBAR1Q8TDU6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPBAR1Q8TDU6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPBAR1Q8TDU6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPBAR1Q8TDU6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPBAR1Q8TDU6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GPBAR1Q8TDU6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GPBAR1Q8TDU6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GPBAR1Q8TDU6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GPBAR1Q8TDU6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPBAR1Q8TDU6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms