Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC148Q8NFR7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC148Q8NFR7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms