Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APCDD1LQ8NCL9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
APCDD1LQ8NCL9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
APCDD1LQ8NCL9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
APCDD1LQ8NCL9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APCDD1LQ8NCL9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms