Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC74

RBBP8NL, RBBP8 N-terminal-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8NLQ8NC74 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBBP8NLQ8NC74 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBBP8NLQ8NC74 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBBP8NLQ8NC74 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBBP8NLQ8NC74 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBBP8NLQ8NC74 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBBP8NLQ8NC74 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBBP8NLQ8NC74 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBBP8NLQ8NC74 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBBP8NLQ8NC74 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RBBP8NLQ8NC74 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBBP8NLQ8NC74 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBBP8NLQ8NC74 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBBP8NLQ8NC74 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBBP8NLQ8NC74 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBBP8NLQ8NC74 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RBBP8NLQ8NC74 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RBBP8NLQ8NC74 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms