Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNBD1Q8NA66 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNBD1Q8NA66 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms