Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PNLDC1Q8NA58 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms