Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8Q1

CYB561D1, Cytochrome b561 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB561D1Q8N8Q1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYB561D1Q8N8Q1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYB561D1Q8N8Q1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYB561D1Q8N8Q1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYB561D1Q8N8Q1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYB561D1Q8N8Q1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYB561D1Q8N8Q1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYB561D1Q8N8Q1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYB561D1Q8N8Q1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYB561D1Q8N8Q1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYB561D1Q8N8Q1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYB561D1Q8N8Q1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CYB561D1Q8N8Q1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYB561D1Q8N8Q1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYB561D1Q8N8Q1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYB561D1Q8N8Q1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYB561D1Q8N8Q1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYB561D1Q8N8Q1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYB561D1Q8N8Q1 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms