Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCL2Q8N4E4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCL2Q8N4E4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms